Pracownia Fizyki w Ekonomii i Naukach Społecznych powstała w roku 1993 w ramach Zakładu Technologii Ciała Stałego i nosiła pierwotnie nazwę Pracownia Dynamiki Nieliniowej Układów Złożonych. Od roku 2008 Pracownia działa pod obecną nazwą jako pracownia samodzielna, i obecnie w jej skład wchodzi jeden profesor, pięcioro adiunktów, pracownik administracyjnego, a także doktoranci i dyplomanci.
Badania prowadzone w pracowni obejmują m.in.: socjofizykę, ekonofizykę, sieci złożone, fizykę statystyczną, układy hierarchiczne i statystyczną eksplorację danych. Wyniki badań były podstawą dla m.in. 14 obronionych rozpraw doktorskich. Pracownia jest częścią Centrum Doskonałości Complex Systems Research utworzonego na Politechnice Warszawskiej w 2002 roku i prowadzi intensywną współpracę międzynarodową, m.in. z ETH Zurych, University of Amsterdam, Université de Genève, Universitat de les Illes Balears, Jožef Stefan Institut i Nanyang Technological University.
Pracownia uczestniczyła w kilkunastu projektach badawczych finansowanych z 6. i 7. Programu Ramowego EU, Horizon 2020 oraz Horizon Europe, w czterech przypadkach pełniąc rolę koordynatora (CREEN – Critical Events in Evolving Networks, CyberEMOTIONS – Collective Emotions in Cyberspace, RENOIR – Reverse Engineering of Social Information Processing, OMINO – Overcoming Multilevel Information Overload). Łączny budżet projektów prowadzonych w Pracowni w latach 2005-2024 wynosił około 20 mln zł.
Kierownikiem pracowni od października 2024 r. jest dr hab. inż. Julian Sienkiewicz. Założycielem i wieloletnim kierownikiem Pracowni FENS jest prof. dr hab. inż. Janusz Hołyst – jeden z pionierów interdyscyplinarnych badań wykorzystujących metody i modele fizyki w ekonomii i socjologii. Profesor Hołyst był w latach 2004-2014 przewodniczącym Zarządu Sekcji Fizyka w Ekonomii i Naukach Społecznych Polskiego Towarzystwa Fizycznego, od roku 2007 jest Prezesem Zarządu Krajowej Rady Koordynatorów Badawczych UE (KRAB), a od roku 2012 Profesorem Honorowym na Uniwersytecie w Wolverhampton.